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Mejoras a los Cálculos para el PTAT

Dr. Tom Lawlor, Director de Investigación, Holstein USA

Cuando 6.5 millones de vacas dejan de ser suficientes? Cuando se están calculando las evaluaciones genéticas para calificación final. Investigadores en la Universidad Georgia han mostrado que una gran mejora en la habilidad de predicción del PTA Tipo (PTAT) y su resultante estabilidad pueden ser logrados mediante la incorporación de la información de pedigree de 1.7 millones de ancestros.

Actualmente, la vaca tiene que haber sido clasificada antes de los 43 meses de edad; o ser la madre de dos o más crías o ser la madre de un toro para ser incluida en las evaluaciones del modelo animal. Desafortunadamente, esto todavía deja por fuera a un número grande de vacas con una sola cría clasificada, y el número de vacas con una sola cría clasificada ha venido creciendo. Las vacas sin registro se han convertido en una parte mas importante en el proceso de prueba de los toros y más vacas registradas están siendo clasificadas bajo programas opcionales.

Cuando una vaca faltaba de la evaluación, un valor promedio de pedigree para el año de su nacimiento era usado. Esto suena lógico para una vaca promedio con un pedigree promedio. Sin embargo, este no es el caso para muchas de nuestras vacas. Encontramos que la calidad del pedigree va de la mano con la calidad de la vaca. En otras palabras, la información de pedigree faltante para una vaca con un buen PTAT era más alta que la información de pedigree faltante para una vaca con un PTAT bajo.

Los genetistas lo llaman apareamientos surtidos positivos (positive assortative mating). Las buenas vacas se preñan con buenos toros y las vacas inferiores con toros promedio o inferiores. Los productores ven esto todo el tiempo. Algunos criadores están muy comprometidos con el mejoramiento de la conformación de sus vacas y solo seleccionan toros con alto tipo o tal vez un criador solo aparea sus vacas buenas con toros buenos.

Table 1

El impacto de los pedigrees adicionales:
El incluir 1.7 millones de pedigrees adicionales tuvo un impacto significativo en las evaluaciones genéticas. En un año dado, las mejores vacas tendían a subir y las menos buenas tendían a bajar. Por ejemplo, para las vacas nacidas en el año base 2000, las 20 vacas superiores en PTAT aumentaron de +3.08 a +3.24 y las 20 mas bajas en PTAT cayeron de -2.58 a -2.65. A través del tiempo, se encontró que la cantidad de mejoramiento genético calculada era mayor que lo que se había estimado antes, pues una ganancia de ligeramente más de cinco puntos ha ocurrido en los últimos20 años.

Cambios esperados en PTAT’s de vacas:
Algunos factores que afectan el PTAT de una vaca son el año de su nacimiento, la adición de nuevos pedigrees a cualquiera de sus parientes o cambios en el PTAT de sus contemporáneas. Por ejemplo, se espera que una vaca nacida en el 2004 suba +0.26, mientras que una vaca nacida en 1994 bajará en promedio -0.53 puntos. Vacas que agreguen una madre con un pedigree extremadamente bueno o malo pueden cambiar hasta un punto para arriba o para abajo. Las vacas en hatos con muy buenos pedigrees deberían ver un aumento en sus PTAT’s por el ajuste de los PTAT’s de sus contemporáneas.

El ranking de los toros será más alto pero sin muchos cambios:
El aumento en la tendencia genética hace que las evaluaciones genéticas de las poblaciones actuales sean más altas. El PTAT promedio de los 400 toros superiores en TPI aumentara en +0.4. Esto significa que el número de toros con un PTAT de +2.50 o más alto y con una confiabilidad de al menos 80% crezca de 14 a 58. En las nuevas evaluaciones hay 20 toros con un PTAT de +3.00 o más.

A pesar de que las pruebas de los toros se verán más altas los nombres serán familiares. Hay un alto nivel de acuerdo entre las evaluaciones viejas y las nuevas. La correlación entre las dos evaluaciones es bastante alta (.985) Por ejemplo, todos los toros nuevos en los Top 10 PTAT se encontraban entre los previos Top 15. Esto significa que toros seleccionados por los PTATs viejos seguirán apareciendo entre los toros altos para tipo de la raza.

Table 2

Mayor predicción y estabilidad en las pruebas:
Los promedios de padres para tipo para toros jóvenes serán más predecibles. Menos bajas atribuibles a los pedigrees fueron observadas para los toros que obtuvieron su primera prueba. En promedio, los PTAs de los toros con primera cosecha estuvieron dentro del 0.1 de su PAT.

La mayor ventaja de las nuevas evaluaciones genéticas es que hay mucha más estabilidad cuando el toro pasa de la evaluación de su 1ra cosecha a la 2da. Los toros que aparecen abajo recibieron su evaluación de la 1ra cosecha en el 2004 y la de su 2da cosecha en el 2007. Bajo el sistema de evaluación viejo, el PTAT de un toro caería -0.44 en promedio, con la mayor caída excediendo fácilmente el mayor incremento. Ahora, los cambios en las pruebas están distribuidos normalmente, i.e., el promedio esta cerca a cero (-0.05) y el mayor aumento es de casi el mismo tamaño que la mayor caída.

Table 3

Vemos la misma historia cuando observamos el número de toros con cambios. El número de toros con alzas o caídas es mucho más normal, 61 suben y 71 caen. El número de cambios extremos en cualquiera de las dos direcciones es más parecido (14 suben y 18 caen) en las nuevas evaluaciones.

Table 4

La principal diferencia que los productores verán es un aumento en los PTAs de los toros más viejos con 2da cosecha. Esto significa que los toros de 2da cosecha estaban siendo subvalorados por el antiguo sistema. Estos cambios deberían ser bien recibidos por productores confundidos por las frecuentes caídas de algunos de los toros más populares.

Ejemplo de algunos cambios para toros de 2da cosecha y de tipo alto (Febrero 2007 solo datos de US).

Table 5

Comparaciones Internacionales:

Table 6

Las nuevas evaluaciones genéticas de U.S. para tipo concuerdan mejor con las pruebas para tipo de otros países. La mayoría de las correlaciones genéticas aumentaron entre 0.02 y 0.04. La única excepción es Francia, que asigna un 60% del énfasis de su calificación final en las ubres.

Conclusiones:
1.7 millones de vacas adicionales se añadieron al sistema de evaluación genética para obtener un estimado más preciso de la contribución de los ancestros de un animal. Esto resultó en una mayor habilidad para predecir el PTAT y su subsiguiente estabilidad. Nuestro estimado del progreso genético para los últimos 20 años ha aumentado en cerca a 5 puntos. Como consecuencia, muchos animales actuales verán un aumento en sus PTATs. Por ejemplo, la prueba promedio de los toros top 400 TPI verán un incremento de +0.4. La principal ventaja de las nuevas evaluaciones genéticas es que habrá mayor estabilidad cuando un toro pase de su evaluación de la 1ra cosecha a la 2da.

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